Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP3Q8IZU3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms