Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF2Q8IX21 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.6 ms