Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM48Q8IWZ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM48Q8IWZ4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms