Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDCD3Q8IVD9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUDCD3Q8IVD9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms