Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA4Q8IV77 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA4Q8IV77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms