Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT12Q8IV01 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT12Q8IV01 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms