Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RAB11FIP4Q86YS3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB11FIP4Q86YS3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms