Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPBP1Q86WP2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPBP1Q86WP2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms