Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASSF3Q86WH2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RASSF3Q86WH2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASSF3Q86WH2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms