Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX20Q7Z614 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX20Q7Z614 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms