Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYFIP1Q7L576 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYFIP1Q7L576 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYFIP1Q7L576 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYFIP1Q7L576 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYFIP1Q7L576 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYFIP1Q7L576 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYFIP1Q7L576 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CYFIP1Q7L576 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYFIP1Q7L576 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYFIP1Q7L576 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYFIP1Q7L576 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms