Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf139Q6ZV77 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf139Q6ZV77 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf139Q6ZV77 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf139Q6ZV77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf139Q6ZV77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf139Q6ZV77 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms