Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP1R3FQ6ZSY5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms