Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRCAPQ6ZRS2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRCAPQ6ZRS2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms