Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSMFQ6X4W1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSMFQ6X4W1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSMFQ6X4W1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms