Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MUC6Q6W4X9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MUC6Q6W4X9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MUC6Q6W4X9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms