Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACS1Q6VY07 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACS1Q6VY07 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACS1Q6VY07 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms