Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C16orf89Q6UX73 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C16orf89Q6UX73 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms