Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCLAT1Q6UWP7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms