Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SAMD1Q6SPF0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SAMD1Q6SPF0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms