Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL54Q6P161 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms