Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDE2Q6IQ49 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDE2Q6IQ49 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms