Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIST2H2AA3Q6FI13 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HIST2H2AA3Q6FI13 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIST2H2AA3Q6FI13 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms