Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHEQ5VZ18 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SHEQ5VZ18 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms