Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF220Q5VTB9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF220Q5VTB9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms