Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP350Q5VT06 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP350Q5VT06 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP350Q5VT06 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms