Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3BQ5T9A4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms