Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF648Q5T619 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF648Q5T619 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms