Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC183Q5T5S1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC183Q5T5S1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC183Q5T5S1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms