Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIVEP3Q5T1R4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms