Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C10orf55Q5SWW7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C10orf55Q5SWW7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms