Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CEP170Q5SW79 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CEP170Q5SW79 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.38■■■■□ 3.58
CEP170Q5SW79 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms