Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNT1Q5JUK3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNT1Q5JUK3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms