Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAVIN4Q5BKX8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CAVIN4Q5BKX8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CAVIN4Q5BKX8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms