Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF394Q53GI3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF394Q53GI3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms