Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2CQ496J9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SV2CQ496J9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SV2CQ496J9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms