Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP100Q494V2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP100Q494V2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP100Q494V2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP100Q494V2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms