Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-BQ31612 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-BQ31612 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms