Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPP1Q16831 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms