Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTN1Q16799 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTN1Q16799 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
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