Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK5Q16478 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIK5Q16478 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms