Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF1AQ15573 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1AQ15573 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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