Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDSNQ15517 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDSNQ15517 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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