Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRKQ15262 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPRKQ15262 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRKQ15262 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRKQ15262 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
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