Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDGFRLQ15198 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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