Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IHHQ14623 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IHHQ14623 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IHHQ14623 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IHHQ14623 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IHHQ14623 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IHHQ14623 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IHHQ14623 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IHHQ14623 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IHHQ14623 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IHHQ14623 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IHHQ14623 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IHHQ14623 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IHHQ14623 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IHHQ14623 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IHHQ14623 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IHHQ14623 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IHHQ14623 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IHHQ14623 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IHHQ14623 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IHHQ14623 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IHHQ14623 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IHHQ14623 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IHHQ14623 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IHHQ14623 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IHHQ14623 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IHHQ14623 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IHHQ14623 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IHHQ14623 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IHHQ14623 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IHHQ14623 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IHHQ14623 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IHHQ14623 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IHHQ14623 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IHHQ14623 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IHHQ14623 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IHHQ14623 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IHHQ14623 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IHHQ14623 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IHHQ14623 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IHHQ14623 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IHHQ14623 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IHHQ14623 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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