Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBX1Q14549 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBX1Q14549 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX1Q14549 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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