Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN5AQ14524 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
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