Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXE3Q13461 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXE3Q13461 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms