Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SF3B2Q13435 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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